Cara, você pode também usar um gerenciador de disco e criar uma partição, muda seus arquivos importantes para essa partição e depois você pode fazer seu upgrade tranquilo.

Depois do upgrade é só mudar seus arquivos para a mesma partição do Windows se assim quiser e usar novamente o gerenciador para refazer seu disco.

Sei lá cara, essa foi a minha idéia e é a que sempre indico como a mais segura.